راستوب : RASTOP

هذا البرنامج يعتبر أحد البرامج التي تهتم بدراسة وفهم البنية الفراغية للبروتينات ووظيفتها حيث يعرض برنامج Rastop على الشاشة الجزيئات في أبعادها الثلاثة مع امكانية التحكم بالشكل والحجم و يشمل مجموعة من التعليمات و الأوامر مكتوبة فوق النافذة الرئيسية في صورة أيقونات  .
يستعمل هذا البرنامج (حسب المناهج الجديدة ) في المستوى الثانوي لشرح البنية الفراغية للبروتينات و فهم العلاقة بين بنية البروتين ووظيفته على مستوى العضوية .
ونحتاجه لـ :
1) عرض البنية الفراغية للجزيئات على الشاشة (بروتينات ، أحماض نووية ......) وتحديد وضعيتها في الفراغ .
2) تغيير عرض الجزيئة باستعمال أزرار العرض من النافذة الرئيسية .
3) عرض عدة جزيئات على نفس النافذة .
4 )التعرف على تركيب وخصائص البروتينات .
5)يعرض جميع ملفات البروتينات ذات الامتداد PDB .
لاستعمال برنامج   Rastop نحتاج  إلى مايلي
 (1) تحميل البرنامج
 (2):تحميل ملفات البروتينات .

توجد الملفات الأصلية للبروتينات في بنك خاص يسمى بنك البروتينات ( Protine Data Bank ( PDB، وكل بروتين له رمز واحد خاص به  فمعرفته تسهل الحصول على ملفات البروتينات ، ونظرا لكثرة عدد البروتينات التي توجد في بنك PDB ( أكثر من 43633 ) اعتمدنا على بعض ملفات البروتينات الموجودة في الموقع التالي :   http://www.ens-kouba.dz/arabic/tlech%

ملاحظة :  يستحسن وضع ملفات البروتينات التي تم حملها في نفس المجلد الذي تم فيه وضع برنامج راستوب .

 أما إذا أردت الحصول على ملفات أخرى من البروتينات اتصل بالموقع التالي :http://www.rcsb.org/pdb
 (3): تعلم طريقة الاستعمال : تكون بمساعدة الأستاذ .
     أ ـ حمل برنامج راستوب( اضغط هنا ) 
     ب ـ تحميل ملفات البروتينات ( في الجدول الموالي ) :

 تسمية البروتين

وصفه  

رمزه

التحميل

lysozyme

إنزيم  مرتبط بالركيزة

1HEW

حمل

lysozyme

إنزيم الليزوزيم مرتبط بـNAG6

1LZS

حمل

carboxy peptidase

إنزيم كربوكسيبتيداز

3CPA

حمل

insuline

هرمون الأنسولين (الإنسان)

2hiu

حمل

myoglobine

بروتين عضلي

1A6G

حمل

oxyhymoglobine

بروتين دموي

2DN1

حمل

carbomonoxyhymoglobine

2DN3

حمل

dhoxyhymoglobine

2DN2

حمل

immunoglobuline

بروتين مناعي

IGGTOTAL

حمل

fab fragment-glucose

IGG  -   LYS

حمل

facilitative glucose

بروتينات ناقلة

1SUK

حمل

pompe de calcium

1WPE

حمل

(photo systeme I (PSI

الأنظمة الضوئية

1JBO

حمل

(photo systeme II(PS

2AXT

حمل

ATP synthetase FO

ATP Synthas

1C17

حمل

ATP synthetase F1

1E79

حمل

potassium channel protein

قناة البوتاسيوم

1BL8

حمل

Nicotinic acetylcholine receptor

مستقبل الاسيتيل كولين

2BG9

حمل