
راستوب : RASTOP
هذا البرنامج يعتبر أحد البرامج التي تهتم بدراسة
وفهم البنية الفراغية للبروتينات ووظيفتها حيث يعرض برنامج Rastop على الشاشة
الجزيئات في أبعادها الثلاثة مع امكانية التحكم بالشكل والحجم و يشمل مجموعة من
التعليمات و الأوامر مكتوبة فوق النافذة الرئيسية في صورة أيقونات
.
يستعمل هذا البرنامج (حسب المناهج الجديدة ) في المستوى
الثانوي لشرح البنية الفراغية للبروتينات و فهم العلاقة بين بنية البروتين ووظيفته
على مستوى العضوية .
ونحتاجه لـ :
1) عرض البنية الفراغية للجزيئات على الشاشة (بروتينات ،
أحماض نووية ......) وتحديد وضعيتها في الفراغ .
2) تغيير عرض الجزيئة باستعمال أزرار العرض من النافذة
الرئيسية .
3) عرض عدة جزيئات على نفس النافذة .
4 )التعرف على تركيب وخصائص البروتينات .
5)يعرض جميع ملفات البروتينات ذات
الامتداد PDB .
لاستعمال برنامج Rastop
نحتاج إلى مايلي
(1) تحميل البرنامج
(2):تحميل ملفات البروتينات .
توجد الملفات الأصلية للبروتينات في بنك خاص يسمى بنك البروتينات ( Protine Data Bank ( PDB، وكل بروتين له رمز واحد خاص به فمعرفته تسهل الحصول على ملفات البروتينات ، ونظرا لكثرة عدد البروتينات التي توجد في بنك PDB ( أكثر من 43633 ) اعتمدنا على بعض ملفات البروتينات الموجودة في الموقع التالي : http://www.ens-kouba.dz/arabic/tlech%
ملاحظة : يستحسن وضع ملفات البروتينات التي تم حملها في نفس المجلد الذي تم فيه وضع برنامج راستوب .
أما إذا أردت الحصول على ملفات أخرى من البروتينات اتصل بالموقع
التالي :http://www.rcsb.org/pdb
(3): تعلم طريقة الاستعمال : تكون بمساعدة الأستاذ .
أ ـ حمل
برنامج راستوب(
اضغط هنا )
ب ـ
تحميل ملفات البروتينات ( في الجدول الموالي ) :
|
تسمية البروتين |
وصفه |
رمزه |
التحميل |
| lysozyme |
إنزيم مرتبط بالركيزة |
1HEW |
|
| lysozyme |
إنزيم الليزوزيم مرتبط بـNAG6 |
1LZS |
|
| carboxy peptidase |
إنزيم كربوكسيبتيداز |
3CPA |
|
| insuline |
هرمون الأنسولين (الإنسان) |
2hiu |
|
| myoglobine |
بروتين عضلي |
1A6G |
|
| oxyhymoglobine |
بروتين دموي |
2DN1 |
|
| carbomonoxyhymoglobine |
2DN3 |
||
| dhoxyhymoglobine |
2DN2 |
||
| immunoglobuline |
بروتين مناعي |
IGGTOTAL |
|
| fab fragment-glucose |
IGG - LYS |
||
| facilitative glucose |
بروتينات ناقلة |
1SUK |
|
| pompe de calcium |
1WPE |
||
| (photo systeme I (PSI |
الأنظمة الضوئية |
1JBO |
|
| (photo systeme II(PS |
2AXT |
||
| ATP synthetase FO |
ATP Synthas |
1C17 |
|
| ATP synthetase F1 |
1E79 |
||
| potassium channel protein |
قناة البوتاسيوم |
1BL8 |
|
| Nicotinic acetylcholine receptor |
مستقبل الاسيتيل كولين |
2BG9 |